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miércoles, 31 de marzo de 2021

Sobre el riesgo de fallecimiento con las mutaciones del SARS-CoV-2

 Sobre el riesgo de fallecimiento con  las mutaciones del SARS-CoV-2

En un post anterior del blog hermano “Opinión sanitaria” hablamos de la variante del  SARS-CoV-2 (severe acute respiratory syndrome) sudafricana y la efectividad sobre ésta de una de las vacunas que actualmente se están administrando; por otro lado, vamos oyendo y viendo en los medios noticias alarmantes sobre la variedad brasileña y el riesgo que se extienda por toda Hispanoamérica, y tenemos la idea de que la variedad británica no supone ningún riesgo ni en la vacunación (así parece en Israel con Pfizer/BioNTech) ni en la gravedad de la misma. ¿Es esto realmente cierto?. 

Hoy hablaremos de un artículo publicado este mes en el BMJ,  sobre la conocida variedad   B.1.1.7, o la “variedad británica” y su mayor o menor gravedad, según los fallecimientos en el Reino Unido (UK). 
La  B.1.1.7 se identificó en octubre del año pasado en sur oeste de Inglaterra en muestras de pacientes afectos de COVID-19.

En diciembre del 2020 la  Public Health England los identificó como VOC-202012/1; una variante que se extendió por todo el suroeste de Londres y el resto del UK, y a fecha del 31 de diciembre se constató que tres cuartas partes de las infecciones por este COVID-19 en dicho país eran atribuibles a esta nueva variante. El segundo confinamiento del país coincidió con el crecimiento de  esta variedad (5 de noviembre a 2 de diciembre).
Los viajes a Europa se restringieron al final de Diciembre para evitar su diseminación fuera de UK, aunque ya se sabía que se encontraba fuera; a partir de este punto la prevalencia de esta variedad se incrementó en Europa y EEUU.

Se diseñaron test de PCR ( polymerase chain reaction) que distinguieran la variedad del  VOC-202012/1 de otras variantes de la  SARS-CoV-2.
La utilización del sistema  Thermo TaqPath ha permitido evaluar la correlación entre los casos de VOC-202012/1 en los que el gen S (spike) negativo mostraba una fuerte asociación con la variante de UK. 

En este sentido, leemos que la VOC-202012/1 tiene hasta 14 mutaciones de genes, ocho de los cuales están implicados en parte en la codificación de la proteína S responsable de la unión celular, lo que dificulta la detección del gen S. Estas mutaciones generan cambios fenotípicos que afectan al mecanismo de unión y con ello podrían incrementar la infectividad.  El estudio que comentamos evalúa en forma de cohorte comparativa en UK,  utilizando la prueba  TaqPath (medida indirecta de la infección por  VOC-202012/1),   los cambios en la presentación clínica, los resultados en forma de ingresos y mortalidad en comparación con las variantes SARS-CoV-2  previas.

Se evaluaron 54.906 parejas de individuos que presentaban test positivos al  SARS-CoV-2 entre octubre y final de enero del 2021 seguidos hasta el 12 de febrero del 2021. Las parejas se hicieron por edad, sexo, raza, geografía,...y solo se diferenciaron según la detección o no del gen de la proteína S utilizando el método de  TaqPath.

Este estudio incluyó alrededor del 8% del total de muertes que ocurrieron durante el período estudiado.
El objetivo primario fue el fallecimiento dentro los 28 días del primer resultado  SARS-CoV-2 positivo.

Según éste la tasa de riesgo en forma de  hazard ratio (HR) de muerte asociada a la infección por la  VOC-202012/1 en comparación con la infección de variedades de  SARS-CoV-2 previas fue de 1,64 (IC 95% 1,32 a 2,04) en pacientes con test positivo a la COVID-19 en la comunidad (p inferior a 0,001). Específicamente el incremento del HR se encontró entre el 1,32 y el 2,04 para las otras variantes viricas que supondrían un incremento del riesgo de muerte del 32% al 104%, pero que se estimaría como más probable un HR de 1,64, es decir un 64% de incremento de en el riesgo de muerte por esta causa. 
 En términos absolutos, estiman que con todo sería un riesgo bajo, aunque del orden de un incremento de entre 2,5 a 4,1 fallecimientos por 1000 casos detectados (¿mucho o poco?).

Concluyen que aún el mayor riesgo de trasmisión del virus,  el riesgo de fallecimiento con la nueva variedad de virus  VOC-202012/01 es mayor que con la anterior 

 Robert Challen, Ellen Brooks-Pollock, Jonathan M Read, Louise Dyson, Krasimira Tsaneva-Atanasova, Leon Danon. Risk of mortality in patients infected with SARS-CoV-2 variant of concern 202012/1: matched cohort study. BMJ . 2021 Mar 9;372:n579. doi: 10.1136/bmj.n579.

Alistair C Darby, Julian A Hiscox. Covid-19: variants and vaccination. BMJ 2021; 372 doi: https://doi.org/10.1136/bmj.n771 (Published 23 March 2021)

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